科学計算やデータ可視化のための python モジュールをひとまとめにして利用できる便利なパッケージで主なものには Enthought 社の Canopy と Continum 社の Aanconda があるようです．どちらもよく使われるものや，データ入出力，処理，可視化のためのモジュールを一通りそろえています．どちらも無償，有償，アカデミック版（無償）がありますが，Canopy の方は入っているパッケージが違う，Anaconda の方は並列計算に対応した追加パッケージ (Anaconda Accelerate) の有無の違いがあります．
Matplotlib はもちろんどちらにも入っているのですが，Matplotlib の 3D 描画機能はまだ十分高機能とは言えないので，複雑なことがしたい場合は Mayavi2 の利用が勧められているようです（とはいっても簡単な 3D plot なら matplotlib で問題ないですが）．
mplot3d FAQ （matplotlib の 3d plot の不具合）http://matplotlib.org/mpl_toolkits/mplot3d/faq.html
しかし Mayavi の利用には VTK をインストールする必要があり，Windows では CMake だの C のコンパイラの準備だのと少し面倒．そこで Enthought 社の Canopy の有償もしくはアカデミック版なら Mayavi や VTK が もともと組み込まれているので，依存関係などを気にせずすぐに使えるようです．3次元での複雑なデータ可視化を python から行いたいなら Canopy でしょうか．
一方 Anaconda Accelerate の方は， python のコードからマルチコアや GPU に対応した並列計算ができるようにコンパイルしてくれる NumbaPro や数値計算ライブラリを含んでいるようです．
python の読みやすいコードで 3 次元可視化や高速な並列計算などが楽にできると嬉しいので，これらの企画の発展に注目しています．
